IT|超越Omicron：科学家们将目光投向COVID-19进化的长期“游戏”( 三 ) 超越Omicron：科学家们将目光投

第二个假设是，在过去的两年里，Omicron可能一直存在，突变在世界的某些地方积累而未被发现，这些地方没有广泛提供诊断测试、基因组测序和疫苗。未来的任何变种都存在这种可能性。
第三种可能性是人类向另一个动物宿主的溢出事件，SARS-CoV-2在那里复制并获得了一系列的基因组变化，然后再跳回人类宿主。
【IT|超越Omicron：科学家们将目光投向COVID-19进化的长期“游戏”】还有一种情况来自于HMS的Jonathan Li的工作。去年，Jonathan 描述了一个免疫力低下的病人连续感染SARS-CoV-2五个月的案例。在整个感染过程中，患者的病毒演变和主要突变都在进行。自从这个里程碑式的报告以来，其他研究人员也报告了类似的慢性SARS-CoV-2患者的病毒进化和变异案例。
Lemieux和Luban指出，在Alpha、Beta、Gamma、Delta及Omicron中出现的许多突变先前已在慢性SARS-CoV-2感染者中注意到，因此无法清除病毒。在新发表的评论中，他们说这些慢性感染可以提供对未来变异的预览，应该定期挖掘新出现的突变。
后果将是什么？
中学的生物课可能给我们中的许多人留下了进化是一个战略选择过程的有点简单化的印象。但是，事实上，进化往往是混乱的。这一特点使得预测一个病原体的进化轨迹具有挑战性。
Lemieux说，进化的两个主要力量是选择和漂变，它们都受制于随机性和机会。
Lemieux说：“选择是一种决定性的力量，但它是在概率的背景下进行的，你有一些倾向于增加或减少适合的东西，但这不是决定它是否被传递的唯一因素，还有很多偶然的力量。”
另一方面，遗传漂变是进化中随机力量的代表，类似于抽签的运气。
Lemieux说：“如果一个突变很幸运，而且恰好发生在一个参与超级传播事件的个体身上，那么从某种意义上说，这个突变是幸运的，因为仅仅由于机会，它被传递到了大量的人身上。”
这就是为什么研究人员不能说大流行病会以这样或那样的方式进行。
“我们不知道，可能我们永远也不会知道会发生什么，它不像我们有一个病毒变体的来源，我们可以直接监测，看看会发生什么，” Lemieux说。“我们住在这座我们看不到的火山旁边，我们不知道它什么时候会爆发。”
然而，即使在不确定的情况下，有一些情况比其他情况更有可能发生。其中一种，也是极不可能的一种，就是这种病毒可能会逐渐消失，进入灭绝状态。
“在这一点上，SAR-CoV-2以一种有意义的方式消失是极其不可能的。这艘船已经起航，”Lemieux说。
Lemieux说，如果该病毒现在要消失，它必须从全球每个地方、每个水库中独立消失，并补充说这“不太可能发生，除非有一些新的疫苗技术，突然诱发消毒免疫，这是可能的。但我不认为在未来几年内会出现这种情况” 。
另一种情况涉及病毒和宿主之间的免疫平衡状态。对这一概念的支持来自于SARS-CoV-2更遥远的进化“表亲”--四种常见的人类冠状病毒，它们已经流传了几个世纪，是地方性的，并且在大多数人年满18岁时就会感染，引起大部分轻微感染。这些人类冠状病毒比SARS-CoV-2最年轻和关系最密切的“亲属”SARS-1和MERS要老得多。
“我们不知道这些冠状病毒是从哪里来的，”Luban说。“它们是一直存在还是像SARS-CoV-2那样最初出现并造成了破坏？”
Luban补充说，这纯属猜测，但这四种病毒在历史上的某个时刻跳入人们体内，在达到平衡状态之前最初造成了很大的破坏，这是可信的。
“SARS-CoV-2会不会朝着这个方向发展？” Luban说。“这种情况在病毒学中是有历史先例的。”