IT|超越Omicron：科学家们将目光投向COVID-19进化的长期“游戏”( 二 ) 超越Omicron：科学家们将目光投

变异是病毒生命周期的一个正常部分。它们发生在病毒复制自身的时候。其中许多突变是无关紧要的，其他突变对病毒本身是有害的，还有一些突变可能为它提供竞争优势。
在2020年初，人们的假设和希望是SARS-CoV-2不会变化得太快。像其他冠状病毒一样，它有一种机制，可以防止病毒基因组在复制过程中发生太多的变化，或错误。
Luban说：“这种病毒具有冠状病毒所特有的校对机制，因此坊间的说法是这些病毒不像其他RNA病毒那样容易出错，如脊髓灰质炎病毒、流感病毒或HIV-1 。”
事实上，在大流行的早期，SARS-CoV-2每月积累了大约两个突变--一个缓慢的变化速度，这支持了最初的预测，即SARS-CoV-2将是一个迟缓的突变者。
然而，包括Luban在内的少数科学家对此并不那么乐观。2020年3月，Luban开始仔细研究1918年流感大流行的数据。他发现了一张引人注目的图表，显示在1918年和1919年期间，英国的死亡人数出现了三次大的高峰，这可能是新的病毒变体引起的重复感染周期的指标。
“这可能是我们在SARS-CoV-2中的走向吗？” Luban想知道。
他向全世界的流感专家和流行病学家提出了这个问题。许多人甚至因为提出这种可能性而感到愤怒，Luban和Lemieux说这种反应可能是出于一种善意的，即使是错位的，让人们放心和避免危言耸听的冲动。
“问题是，如果你说房子没有着火，大多数时候你是对的，房子没有着火，”Lemieux说。“但有时当火警警报响起时，要做的事情就是疏散房屋里的人员。”
在SARS-CoV-2的基因组中出现了一些不祥的变化，使Luban的怀疑得到了放大。其中一个变化是改变了称为D614G的刺突蛋白的突变。Luban注意到了这一点，因为它让他想起了他在前两次爆发的埃博拉病毒中研究的突变--在病毒用来入侵人类细胞的蛋白质机制中的单个氨基酸交换。这让Luban和一些志同道合的同事认为，这种突变可能是一种适应性，可以增加SARS-CoV-2的感染性--就像埃博拉病毒的类似变化。
2020年秋天，第一个令人担忧的变体Alpha 出现了，在全球掀起了疾病和死亡的浪潮。
Luban说：“出现了一种变体，它的突变可能比之前大流行的任何菌株中出现的突变多10倍。它席卷了整个地球并占领了整个地球，突然间，对话发生了变化。”
重叠的COVID突变
从那时起，新的变体已经出现：Beta、Gamma、 Delta及 Omicron 。而感染、住院和死亡的周期一直在持续，与1918-1919年流感爆发期间的死亡浪潮并不一样，这引起了Luban的注意。
Lemieux说，这已经成为一种大流行性的变种。它们出现了，被识别了，并在人类和动物模型中被描述出来。单克隆抗体疗法现在可以根据变异体进行定制，最终疫苗可能会根据变异体进行校准。
Lemieux说：“想想我们已经走了多远，大流行病在多大程度上是变异体，这太疯狂了。”
有关该病毒未来进化的一些线索可能来自 Omicron的过去。虽然 Omicron的来源仍然是一个科学猜测的问题，可能永远不会得到解决，但研究人员有四种起源理论，它们同样适用于 Omicron和以前关注的变体。
这意味着这些起源机制中的任何一个都可能产生下一个变体。
第一个理论是围绕着可能使其他变异积累起来的关键性变异。Luban将这些突变描述为本身对变异体的传播性可能不是那么重要，但可能是其他重要突变的关键促成因素。这就是例子。D614G是一个关键性的突变。没有它，Alpha, Beta及Gamma 变体就不会发生。
Luban说，这种关键突变已经并将可能成为病毒进化的一个永久特征，并可能导致新变体的出现。