IT|超越Omicron：科学家们将目光投向COVID-19进化的长期“游戏” 超越Omicron：科学家们将目光投

在去年12月的一个星期五下午，130多名科学家聚集在一个Zoom会议上，讨论Omicron（奥密克戎）变体，即当时最新的SARS-CoV-2变体，它以强大的感染力影响全球。出现会议上的科学家们来自不同的学科--病毒学、流行病学、传染病学、免疫学、计算生物学、重症医学；跨越了不同的机构--哈佛医学院、马萨诸塞州总医院、布莱根妇女医院、布罗德研究所、波士顿大学、马萨诸塞大学；跨越了国家--美国、南非、博茨瓦纳、英国和印度。

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当天引发多轮讨论的问题包括：Omicron是从哪里来的？它是否更有能力躲避免疫系统的防御？它的毒性是否比以前的变种更强？疫苗和治疗方法将如何抵御它？
在撰写这篇报道时，Omicron已经在许多地方引发感染病例激增，一个“姐妹”亚变体（BA.2）已经开始站稳脚跟，其中一些问题已经得到解答。
然而，在这一呼声中提出的问题的重要性超出了Omicron 。它们将是科学家在任何变体出现时可能面临的同样的未知数。从这个意义上说，Omicron可能不是病毒进化故事的结束，而只是情节的一个转折。
了解这种病毒的进化策略是马萨诸塞州病原体准备联盟的病毒变体研究小组的任务，这是一项由哈佛医学院领导的国际科学努力，成立于2020年3月，旨在解决COVID-19大流行病的当前和长期挑战并加强对未来的准备。
MassCPR研究人员Jake Lemieux和Jeremy Luban共同领导着病毒变体组，他们的同事每周都会主持这些国际性的、多机构的、多学科的 Zoom 电话会议，努力绘制病毒不断变化的生物学和行为，揭示其新获得的特征如何可能改变病毒与人类宿主的互动方式，并收集关于病毒进化未来的线索。
“我们处理的复杂问题涉及从病人护理到原子结构的全部专业知识，”Luban说，他是UMass医学院的分子医学、生物化学和分子药理学教授。“这些电话让所有这些专家一起工作，互相教育各自的领域。”
“大流行病以非常具体的方式将社区聚集在一起，其中一些可能会在很久之后仍然存在，”Lemieux说，他是HMS的医学讲师和麻省总医院的传染病专家。“跨实验室、跨机构、跨地理区域合作的障碍比以往要低得多。”
广义上讲，该小组的首要问题是。该病毒将如何演变？会有什么后果？我们能做些什么？

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病毒将如何演化：过去是序幕？
人类心理学中有一句格言：对未来行为最好的预测是过去的行为。这在病毒的情况下也可能是正确的（在一定程度上）。了解一个病原体的进化史很重要，但还不足以预测它可能的走向。SARS-CoV-2的进化记录太短，无法对其未来提供有意义的洞察力。而且该病毒迄今为止的记录强调了其不可预测的性质。
其他冠状病毒能提供线索吗？Luban和Lemieux警告说，也许可以，但不是非常可靠的线索，因为每种冠状病毒都是自己的实体，这使得进行更广泛的比较具有挑战性。
“SARS-CoV-2的一些比较者将是SARS-CoV-1和MERS-CoV，它们是已经感染了人们的相关病毒，”Luban说。“它们是很好的例子，说明预测我们的方向是多么的不可能，因为SARS-CoV-1已经灭绝了，而MERS-CoV具有完全不同的感染方式，并且在动物库中持续存在。”
导致预测困难的另一个因素是关于冠状病毒的现有知识相对稀少。Luban说，世界在进入COVID-19大流行的时候，只有少数冠状病毒专家。2000年代中期，在第一次SARS爆发后，人们对这一领域的兴趣以及研究资金达到了顶峰，但此后迅速减弱，给科学界留下了一些严重的盲点。其中之一就是SARS-CoV-2的变异倾向。