IT|科学家重新利用FDA批准的药物来对抗所有COVID-19变体

根据宾夕法尼亚州立大学科学家领导的一项新研究,几种已获美国食品药品监督管理局(FDA)批准的药物--包括治疗2型糖尿病、丙型肝炎和艾滋病毒的药物--大大降低了SARS-CoV-2的Delta变体在人类细胞中的复制能力 。具体来说,研究小组发现这些药物抑制了某些病毒酶,即蛋白酶,这些酶对SARS-CoV-2在受感染的人类细胞中的复制至关重要 。
宾夕法尼亚州立大学生物化学和分子生物学副教授Joyce Jose说:“SARS-CoV-2疫苗的目标是刺突蛋白,但这种蛋白处于强大的选择压力之下,正如我们在Omicron身上看到的那样,它可能发生重大突变 。仍然迫切需要SARS-CoV-2的治疗药物,这些药物针对的是病毒中除刺突蛋白以外的其他部分,这些部分不那么容易进化 。”

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以前的研究表明,两种SARS-CoV-2酶--包括Mpro和PLpro的蛋白酶--是有希望成为抗病毒药物开发的目标 。例如,辉瑞公司的COVID-19疗法Paxlovid针对Mpro 。据Jose称,这些酶是相对稳定的;因此,它们不太可能迅速产生耐药性突变 。
宾夕法尼亚州立大学生物化学和分子生物学教授Katsuhiko Murakami指出,这些病毒蛋白酶由于具有裂解或切割蛋白质的能力,对SARS-CoV-2在受感染细胞中的复制至关重要 。
“SARS-CoV-2从其RNA基因组中产生长的蛋白质,称为多聚蛋白,这些蛋白质必须被这些蛋白酶有序地切割成单个蛋白质,导致形成功能性病毒酶和蛋白质,一旦进入细胞就开始病毒复制,”Murakami解释说 。“如果你抑制了这些蛋白酶中的一种,就可以阻止SARS-CoV-2在感染者中的进一步传播 。”
这些发现于2月25日发表在《通信生物学》杂志上 。
该团队设计了一种检测方法,在活的人类细胞中快速识别Mpro和PLpro蛋白酶的抑制剂 。
Jose说:“虽然有其他的检测方法,但我们设计的新型检测方法可以在活细胞中进行,这使我们能够同时测量抑制剂对人类细胞的毒性 。”

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研究人员用他们的检测方法测试了64种化合物库--包括艾滋病毒和丙型肝炎蛋白酶的抑制剂;发生在某些原生动物寄生虫中的半胱氨酸蛋白酶;以及二肽基肽酶,一种参与2型糖尿病的人类酶--以测试它们抑制Mpro或PLpro的能力 。从这64个化合物中,研究小组确定了11个影响Mpro活性的化合物和5个影响PLpro活性的化合物,其截止点是蛋白酶活性降低50%,细胞存活率为90% 。
生物化学和分子生物学副研究教授Anoop Narayanan使用活体共聚焦显微镜监测了这些化合物的活性 。
Narayanan说:“我们设计的实验是,如果化合物影响了蛋白酶,你会在细胞的某些区域看到荧光 。”
【IT|科学家重新利用FDA批准的药物来对抗所有COVID-19变体】接下来,该团队在宾夕法尼亚州立大学Eva J. Pell ABSL-3高级生物研究实验室的BSL-3设施中评估了16种PLpro和Mpro抑制剂对SARS-CoV-2病毒的抗病毒活性,并发现其中8种对SARS-CoV-2具有剂量依赖的抗病毒活性 。具体来说,他们发现Sitagliptin和Daclatasvir抑制PLpro,而MG-101、Lycorine HCl和Nelfinavir mesylate抑制Mpro 。其中,研究小组发现,MG-101还通过抑制蛋白酶对刺突蛋白的处理,阻碍了病毒感染细胞的能力 。
“我们发现,当用选定的抑制剂预处理细胞时,只有MG-101影响病毒进入细胞,”Narayanan说 。