科学探索|研究确定了1200多种跟碳通量有关的RNA病毒( 二 )
研究显示,虽然生物多样性在赤道附近的温暖地区趋于扩大而在靠近寒冷的两极地区则下降,但Zayed指出,基于网络的生态互动分析显示,RNA病毒物种的多样性高于北极和南极地区的预期 。
“当涉及到多样性时,病毒并不关心温度,”他说道,“在极地地区,病毒和细胞生命之间有更明显的相互作用 。这告诉我们,我们在极地地区看到的高多样性基本上是因为我们有更多的病毒物种在竞争同一个宿主 。我们看到较少的宿主种类,但有更多的病毒种类感染同一宿主 。”
研究团队使用了多种方法来确定可能的宿主 。首先他们根据海洋浮游生物中的病毒分类来推断宿主,然后根据病毒和宿主的数量如何“共同变化”进行预测--因为它们的丰度是相互依赖的 。第三个策略则包括寻找RNA病毒在细胞基因组中整合的证据 。
Dominguez-Huerta解释称:“我们研究的病毒不会自己插入到宿主的基因组中,但许多病毒会意外地被整合到基因组中 。当它发生时,这是一条关于宿主的线索,因为如果你在宿主基因组内发现一个病毒信号,那是因为在某些时候病毒在细胞内 。”
虽然大多数dsDNA病毒被发现会感染细菌和古细菌,而这些细菌和古细菌在海洋中非常丰富,但这项新分析发现,RNA病毒大多会感染真菌和微生物真核生物,在较小程度上感染无脊椎动物 。只有极小部分的海洋RNA病毒感染细菌 。
该分析还意外地发现,在95种RNA病毒中散布着72个功能不同的辅助代谢基因(AMGs),这提供了一些最好的线索--说明这些病毒感染哪种生物及它们试图重新编程哪些代谢过程以便最大限度地“制造”海洋中的病毒 。
据悉,进一步基于网络的分析确定了1243种跟碳输出有关的RNA病毒,非常保守地讲,有11种病毒被暗示参与了促进向海底的碳输出 。其中,跟藻类家族的宿主有关的两种病毒被选为最有希望的后续目标 。
Sullivan说道:“建模已经到了我们可以从这些大规模的基因组调查中提取基因袋并绘制代谢图的地步 。我设想我们使用AMG和这些被预测为感染特定宿主的病毒来实际拨动这些代谢图以获得我们需要的碳 。而正是通过这种新陈代谢活动,我们可能需要采取行动 。”
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