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机体自身代谢
机体在新陈代谢的过程中，会在酶催化电子转移的过程中产生许多自由基中间体，某些药物在体内以自由基中间体的活性形式发挥作用，生物体内活性氧的代谢产生自由基，过度运动因缺氧产生的自由基 。
放射线照射
1.放射线可直接或间接地对生物体发生作用，促使生物体组织成分的分子发生离子化，生成少量自由基，使机体被损害 。
2.生物体内含有大量水，放射线首先使水分解，产生活性非常高的自由基——氧自由基和羟自由基等，氧自由基和羟自由基可产生多种氧化效应，如破坏机体各组织细胞 。
机体周围自由基前身物的转变
我们周围环境有各种自由基或产生自由基的多种物质存在，如汽车排出的碳化氢、氟利昂见光分解产生碳的自由基及卤原子、吸烟产生的尼古丁自由基、臭氧转变成过氧化物自由基、某些食物久放自由基含量升高、烹饪时产生的油烟、某些脂类含有自由基的前身物以及过氧化物、某些药物、激素和类固醇在体内代谢产生自由基等等 。这些物质被人体吸收或接触，很容易生成自由基 。
自由基对人体的危害
衰老 衰老因素很多，其中最常见的内源性生化因子是自由基 。老年动物及老年人血清脂质自由基水平增高，脂质自由基的分解产物为醛类，可以使蛋白质变性，使酶失活 。这些变性物质被吞噬细胞吞噬消化不完全，导致色素增多，脑组织、肝细胞和其他组织内脂褐素含量增多 。所以自由基会造成人体衰老 。
动脉粥样硬化及脑血栓 机体缺血缺氧后,细胞外液中的钙离子内流进激活磷脂酶A2后，通过一系列反应最终生成氢过氧化物，在血栓素合成酶作用下,生成血栓素(TXA2)，血栓素是强烈的血管收缩剂和血小板聚集剂，血栓素的量及作用增多增强,会导致血管痉挛和促进血栓形成 。
脑的再灌流性损害【自由基是如何产生的】 缺血后再灌流氧自由基的产生，是脑再灌流性损害的根本 。通常情况下，机体自由基的生成与清除能力保持动态平衡 。当缺血时，清除自由基的超氧化物歧化酶和谷胱甘肽过氧化物酶降低，但在再灌流时自由基反应更为明显 。因为脑缺血后在缺血期花生四烯酸代谢与氧自由基反应即已激活，脑再供血后，脑组织脂质过氧化反应更趋严重 。
巴金森氏症 自由基破坏脑部，使得神经传导物质多巴胺缺乏所造成 。多巴胺是和运动有关的神经传导物质，缺乏巴多胺会造成手部不自主顫抖，肌肉麻麻痹动作迟缓等临床症状 。
白內障 眼球中水晶体的蛋白分子受到自由基攻击、氧化，使眼球之水晶体混浊不清，光线、影像无法进入视网膜，影响视力 。
皮肤癌 紫外线会产生自由基，使皮肤出现角化、粗糙、产生斑点，更严重的是会引起表皮细胞变性，产生皮肤癌 。
风湿性关节炎等发炎性疾病 当有病毒或细菌入侵身体时，白细胞会制造大量的自由基来消灭外来的病菌；但是过量的自由基除了吞噬病毒和细菌外，也会伤害附近的组织细胞，使发炎症状恶化 。
糖尿病 胰腺中的β细胞会分泌胰島素，帮助血液中的葡萄糖進入细胞中，转换成组织运作所需要的能量，或将多余的糖分储存在肝、肌肉或脂肪细胞中 。一旦β细胞被自由基氧化，这个功能将停摆，形成糖尿病 。
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