经过一段时间锻炼后，逐渐会有新的体会和认识产生，便有可能进入到中级掌握阶段 。 这一阶段的特点是肌肉可以在自我意识的调节下，完全放松下来，精神也可以进入似睡非睡、似醒非醒的入静状态，主观上可以感觉到全身舒适，心情舒畅，客观上可以引起全身各系统的功能变得协调，从而起到健身防病、治疗某些疾病的作用 。 并因此而对气功产生更进一步的认识 。
第三阶段则是气功锻炼的高级阶段，练功人经过此期反复的训练，已能熟练自如地进到入静状态，其生理机制是一个新的条件反射建立起来了 。 练功中只要一给予条件，立即就能进到入静状态 。
尤其是这一阶段可以发挥意识能动性，做到意感相随，使体内练功中产生的感觉能随意念要求出现或运行到病变的部位，名之为“气至病所” 。
实现上述三个阶段的关键是反复实践，即坚持练功 。 不经过艰苦的锻 炼 过 程，三天打鱼，两天晒网，就不可能亲身体会到气功的奥妙，也不可能对气功有确切的认识 。 反之，气功锻炼又必须具有正确的气功理论作指导，没有正确的理论指导的实践不仅带有盲目性，而且也不可能使练功阶段深入下去，搞不好甚至还有可能引起练功偏差，造成练气功不仅没能治病，反而增加了一个气功病的恶果 。
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