科学探索|科学家用新的无细胞蛋白质结晶方法推进结构生物学的发展

东京理工大学开发了一种新的无细胞蛋白质结晶(CFPC)方法 , 包括直接的蛋白质结晶 , 是结构生物学领域的一个重大进步 。这项技术将使我们能够分析用传统方法无法研究的不稳定的蛋白质 。分析这些将增加我们对细胞过程和功能的了解 。
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CFPC过程的示意图 , 使用小麦胚芽蛋白合成试剂盒合成多面体单体(PhM) , 并进一步结晶为纳米级多面体晶体 。资料来源:Takafumi Ueno教授
我们大多数人都熟悉某些晶体 , 如盐和糖 , 我们在日常生活中使用这些晶体 。然而 , 还有一组隐藏在肉眼之外的晶体 , 对我们的生物学至关重要 。在活细胞中 , 微观的蛋白质晶体帮助维持免疫系统激活、蛋白质储存和保护等过程 。
科学家们开发了细胞内蛋白质结晶(ICPC)方法 , 以更好地了解蛋白质晶体的结构和功能之间的关系 。这种方法可以直接观察活细胞中的蛋白质晶体 , 确保高质量的晶体 , 而不需要纯化过程或复杂的筛选方法 。然而 , 尽管它有许多优势 , 但由于在活细胞中形成的晶体没有分析所需的大小和质量 , 所以报告的结构很少 。因此 , 由东京理工大学的Takafumi Ueno教授领导的一个日本科学家团队旨在开发一种更好的方法 。而最近 , 他们取得了突破性进展 。
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多面体晶体(PhCs)的扫描电子显微镜图像和尺寸分布直方图显示了随时间变化的CFPC过程中的不同点 。资料来源:Takafumi Ueno教授
在他们将于今天(10月3日)发表在《科学报告》上的文章中 , 该团队报告了一项技术的发展 , 该技术将使蛋白质结晶和分析更加高效和有效 。这种技术--无细胞蛋白质结晶(CFPC)方法--是体外蛋白质结晶和ICPC的混合体 , 可以快速直接形成蛋白质晶体 , 而不需要复杂的结晶和纯化方法 。
"ICPC有望成为晶体结构分析的一个重要工具 , 但我们需要一种方法来获得分辨率更高的蛋白质晶体结构 。因此 , 我们专注于利用CFPC建立高质量的蛋白质结晶 , 并进行小规模的快速反应 , "上野教授说 , 他也是东京理工大学上野实验室的负责人 。该实验室的成员研究自然发生的蛋白质组合 , 它们的结构和功能 , 旨在应用这些知识来开发创新的生物技术和能源解决方案 。(进行当前研究的研究小组中的一些科学家也是上野实验室的成员) 。
【科学探索|科学家用新的无细胞蛋白质结晶方法推进结构生物学的发展】研究小组使用了一个小麦胚芽蛋白合成试剂盒 , 这是一种用于合成多面体单体的工具 , 多面体单体是一种在昆虫细胞中通过Hypovirus感染产生的病毒蛋白 。然后使用新的CFPC方法对这种蛋白质进行结晶 , 从而形成纳米级的多面体晶体(PhCs) 。科学家们可以在6小时内有效地完成这一过程 , 期间只用了20微升的反应混合物 。扫描电子显微镜图像表明 , PhCs具有极佳的纯度 , 这使得他们能够以高达1.95?(或1.95?)的分辨率确定其结构 。为了进一步探索他们新系统的能力 , 研究人员对结晶包涵蛋白A(CipA)进行了结构分析 , 其结构被确定为2.11?的高分辨率 , 这在这项研究之前从未被报道过 。