科学探索|新研究揭示重症COVID-19与其他疾病之间的遗传联系

对美国退伍军人事务部“百万退伍军人计划”的数据进行的一项新分析发现了COVID-19严重程度与各种医疗条件之间的遗传联系,这些医疗条件是重症COVID-19的已知风险因素 。美国宾夕法尼亚州费城Michael Crescenz退伍军人医疗中心的Anurag Verma及其同事于2022年4月28日在开放性期刊PLOS Genetics上发表了这些发现 。
一些COVID-19患者的病情比其他人更严重 。以前的研究已经发现特定人类基因的某些变异与一个人经历更严重的COVID-19有关 。这些变异中的一些也可能与其他可能已经被充分理解的医疗条件有关;发现这些共同的变异可以增加对COVID-19的理解,并揭示潜在的新的治疗路径 。

科学探索|新研究揭示重症COVID-19与其他疾病之间的遗传联系
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虽然与重症COVID-19相关的基因与既定的风险因素和不良后果有关,包括深静脉血栓,但这些基因的一个重要子集与免疫介导的疾病(如银屑病、红斑狼疮和类风湿性关节炎)的风险降低有相反的关系 。来源: Anurag Verma, Katherine Liao, and Scott Damrauer (CC-BY 4.0)
为了识别共享变种,Verma及其同事使用了一个前所未有的基因型信息数据集,该数据集与超过65万名美国退伍军人的电子健康记录数据(EHR)相连 。他们进行了一种被称为全表型关联研究(PheWAS)的分析,以检查在经历重症COVID-19的退伍军人中经常发现的变种与与广泛选择的医疗条件有关的变种之间的联系 。
分析显示,与COVID-19有关的某些变种也与COVID-19的已知风险因素有关 。与静脉栓塞和血栓形成以及2型糖尿病和缺血性心脏病有关的变异被发现有特别强的联系--这是两个已知的COVID-19风险因素 。
该分析还发现非洲和西班牙裔退伍军人的重症COVID-19和中性粒细胞减少症之间的遗传联系;这些联系在欧洲裔退伍军人中没有出现 。
在呼吸系统疾病中,特发性肺纤维化和慢性肺泡病与严重的COVID-19有遗传联系,但其他呼吸道感染和慢性阻塞性肺病(COPD)则没有 。一些与重症COVID-19相关的变体也与自身免疫性疾病(如银屑病和狼疮)的风险降低有关 。这些发现强调了在开发新的治疗方法时需要仔细权衡免疫系统的各个方面 。
尽管PheWAS方法有一些局限性,但这些发现可以帮助加深对COVID-19的理解并指导新疗法的开发 。
Verma总结说:"这项研究表明了大型生物库的价值和影响,它将遗传变异与EHR数据联系起来,用于应对当前和未来的大流行病的公共卫生 。MVP是美国最多样化的队列之一 。我们有一个独特的机会来扫描COVID-19大流行之前记录的数千种情况 。我们获得了对COVID-19风险因素和疾病并发症的遗传结构的深入了解 。"
【科学探索|新研究揭示重症COVID-19与其他疾病之间的遗传联系】共同作者Katherine Liao补充说:"让我们眼前一亮的是,大量免疫介导的疾病与COVID-19的严重表现共享遗传结构 。这些关联的性质使我们了解到SARS-CoV2病毒是如何推到人类免疫系统的压力点上的,以及它在抗击感染的同时保持足够的控制,以便它不会也成为一个自身免疫的过程,攻击自我 。"