HBV的变异有多种，与临床关系密切的变异如下：
（1）前C区变异，有病毒复制，但HBeAg阴性，抗HBe阳性，临床上持续慢性化，对干扰素的疗效差 。
（2）S基因变异：这类病人的HBsAg不能表达，故在临床检测中呈阴性 。如果感染S基因变异病毒，接种疫苗预防可能无效 。
（3）YMDD变异，病毒株在药物作用下，选择性变异，对拉米夫定耐药 。
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