●不要将所有文件都存放在根目录下 。 有网站制作者为了方便 ， 将所有文件都放在根目录下 。 这样就很容易造成：文件管理混乱 ， 搞不清哪些文件需要编辑和更新 ， 哪些无用的文件可以删除 ， 哪些是相关联的文件 ， 影响工作效率；上传速度变慢 ， 服务器一般都会为根目录建立一个文件索引 ， 如果将所有文件都放在根目录下 ， 那么即使只上传更新一个文件 ， 服务器也需要将所有文件再检索一遍 ， 建立新的索引文件 ， 很明显 ， 文件量越大 ， 等待的时间也将越长 。
●按栏目内容建立子目录 。 子目录的建立 ， 首先按主栏目建立 。 友情连接内容较多 ， 需要经常更新的可以建立独立的子目录 。 而一些相关性强 ， 不需要经常更新的栏目 ， 例如：网站简介、站长情况等可以合并放在一个统一目录下 。 所有程序一般都存放在特定目录 ， 例如：CGI程序放在cgi-bin目录 ， 所有提供下载的内容也最好放在一个目录下 ， 便于维护管理 。
●在每个主目录下都建立独立的Images目录 。 一般来说 ， 一个站点根目录下都有一个默认地Images目录 。 将所有图片都存放在这个目录里很是不方便 ， 比如在栏目删除时 ， 图片的管理相当麻烦 。 所以为每个主栏目建立一个独立的Images目录是方便管理的 。 原因很简单 ， 就是方便维护与管理 。
其它需要注意的还有：目录的层次不要太深 ， 不要超过3层；不要使用中文目录 ， 使用中文目录可能对网址的正确显示造成困难；不要使用过长的目录 ， 太长的目录名不便于记忆；尽量使用意义明确的目录 ， 以便于记忆和管理 。
网站的链接结构是指页面之间相互链接的拓扑结构 。 它建立在目录结构基础之上 ， 但可以跨越目录 。 形象的说：每个页面都是一个固定点 ， 链接则是在两个固定点之间的连线 。 一个点可以和一个点连接 ， 也可以和多个点连接 。 更重要的是 ， 这些点并不是分布在一个平面上 ， 而是存在于一个立体的空间中 。 一般的 ， 建立网站的链接结构有两种基本方式：
●树状链接结构（一对一） ， 这类似DOS的目录结构 ， 首页链接指向一级页面 ， 一级页面链接指向二级页面 。 这样的链接结构浏览时 ， 一级级进入 ， 一级级退出 ， 条理比较清晰 ， 访问者明确知道自己在什么位置 ， 不会“不知身在何处” ， 但是浏览效率低 ， 一个栏目下的子页面到另一个栏目下的子页面 ， 必须回到首页再进行 。
●星状链接结构（一对多） ， 类似网络服务器的链接 ， 每个页面相互之间都建立有链接 。 这样浏览比较方便 ， 随时可以到达自己喜欢的页面 。 但是由于链接太多 ， 容易使浏览者迷路 ， 搞不清自己在什么位置 ， 看了多少内容 。
因此 ， 在实际的网站设计中 ， 总是将这两种结构混合起来使用 。 网站希望浏览者既可以方便快速地达到自己需要的页面 ， 又可以清晰地知道自己的位置 。 所以 ， 最好的办法是：首页和一级页面之间用星状链接结构 ， 一级和二级页面之间用树状链接结构 。 关于链接结构的设计 ， 在实际的网页制作中是非常重要一环 ， 采用什么样的链接结构直接影响到版面的布局 。
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