【肺部】
吸烟会引致肺癌 。 90%的总死亡率是由吸烟所导致 。 一个人每天吸食十支烟 ， 其患病率是非吸烟人士之十倍 。 被破坏的细胞不能回复正常 。 初期病徵不会被察觉 ， 直至癌性细胞漫延至血管及其他器官 。 吸烟亦会引致肺气肿 ， 肺部支气管内积聚之有毒物质 ， 会阻碍人体吸入之空气正常呼出 ， 令肺部细胞膨胀或爆裂 ， 导致患病者呼吸困难 。
【胃部】
患有肠胃性疾病者 ， 吸烟足以使肠胃病更恶化 。 患有胃溃疡或十二指肠溃疡者 ， 溃疡处的愈合会减慢 ， 甚至演变为慢性病 。 吸烟能刺激神经系统 ， 加速唾液及胃液的分泌 ， 使胃肠时常出现紧张状态 ， 导致吸烟者食欲不振 。 另外 ， 尼古丁会使胃肠黏膜的血管收缩 ， 亦令食欲减退 。
【骨骼】
吸烟人士的断骨康复期要比不吸烟人士长 。 可能是烟所含的尼古丁及一氧化碳拖缓了骨胳的再生的进度 。 尼古丁令血管收缩 ， 降低了流到新生骨骼的血量 。 吸烟时吸入的一氧化碳 ， 亦同时减少进入身体的氧气比率 。 吸烟会引致盘骨炎及背痛 。 每天抽烟十支以上 ， 将盘骨炎患病率提高一倍 。 有严重背痛的人大部份都有很大烟瘾 ， 这是由於吸烟会引致流向关节盘的血液减少 ， 关节盘因而提早退化 。 吸烟会引致关节炎 。 每天吸食一包烟 ， 将提高患病率达50% 。 停经后女性吸烟者更容易患骨折及关节病 。 吸烟导致骨质流失更快 。 妇女由青春期至踏入更年期 ， 每日持续吸烟一包 ， 其骨骼比非吸烟者少百分之五至十 。 当步入更年期后吸烟者的骨质流失率更快 。 吸烟会干扰雌激素 ， 而雌激素正是骨骼发展的重要荷尔蒙 。
【支气管】
吸烟是导致慢性阻塞气管疾病的主要发病因素 。 因为吸烟能引致支气管上皮细胞的纤毛变短和不规则及其和运动发生障碍 ， 降低局部性抵抗力 ， 容易受到感染 。
【肝脏】
吸烟会加重肝脏负担 。 经常抽烟会影响肝脏的脂质代谢作用 ， 令血中脂肪增加 ， 使到良性胆固醇减少 ， 恶性胆固醇增加 。 这个原因令肝脏的解毒功能增加负担 。
【肠】
吸烟会导致结肠癌 。 患此癌的机会则与吸食烟草的份量成正比 。 研究显示停止吸烟虽然可以减低其他疾病例如心脏病、肺癌等的机会 ， 但患上结肠癌的危险就仍然非常大 。
【眼部】
吸烟会引起白内障 ， 影响视力 。 研究显示每天吸烟超过一包的白内障患者是从不吸烟者的2倍 。
【二手烟】
二手烟是由香烟、烟斗或雪茄燃烧时 ， 飘出来或吸烟者抽烟时呼出的一种混合烟雾 。 在许多吸烟的场所中 ， 二手烟是最常接触到的污染物 。 抽烟时喷出的烟雾可散发超过四千种气体和粒子物质 ， 大部分这些物质都是很强烈的刺激物 ， 其中至少有四十种在人类或动物身上可引致癌病 。 在抽烟者停止吸烟后 ， 这些粒子仍能停留在空气中数小时 ， 可被其他非吸烟人士吸进体内 ， 亦可能和氡气的衰变产物混合一起 ， 对人体健康造成更大的伤害 。
当吸烟危害吸烟者本身健康的同时 ， 二手烟也影响非吸烟者 。 除了刺激眼、鼻和咽喉外 ， 它也会明显地增加非吸烟者患上肺癌和心脏疾病的机会 。 如果儿童与一些吸烟人士同住的话 ， 他们的呼吸系统会较容易受到感染 。 其他影包括增加咳嗽、气喘、痰多、损坏肺部功能和减缓肺部发育 。
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