IT|哈佛研究人员解决了一个令人困惑的癌症之谜( 二 )


“我们假设,如果你看一下这些突变对当地表观遗传学的影响--具体来说,它们是否导致附近的DNA更紧密或更松散地缠绕--我们将能够检测到在基于表达的研究中不明显的变化,”Gusev说 。
Gusev表示:“如果一个突变对疾病有影响,这种影响可能太微妙,无法在基因表达水平上捕捉到,但可能不会太微妙,无法在局部表观遗传学水平上捕捉到--在突变周围发生了什么 。”
这就好比以前的研究试图了解加利福尼亚的一场大火如何影响科罗拉多州的天气,而Gusev和Grishin则想看看它对火灾发生地的山坡的影响 。
为了做到这一点,他们进行了不同类型的叠加研究 。他们采用了关于癌症相关突变的GWAS数据和七种常见类型癌症的表观遗传学变化数据,并研究了它们是否--以及在哪里--有交集 。
结果与同位素研究的结果形成了鲜明的对比 。“我们发现,虽然大多数非编码突变对基因表达没有影响,但它们中的大多数确实对局部表观遗传调节有影响,”Gusev说 。“我们现在对绝大多数癌症风险突变如何与癌症有潜在联系有了基本的生物学解释,而以前并不知道这种机制 。”
利用这种方法,研究人员创建了一个突变数据库,这些突变现在可以通过一个已知的生物机制与癌症风险联系起来 。该数据库可以作为研究药物的一个起点,通过针对该机制,可以降低个人患某些癌症的风险 。
Gusev说:“例如,如果我们知道某种转录因子(一种参与开启和关闭基因的蛋白质)与这些癌症相关的突变之一结合,我们也许能够开发出针对该因子的药物,有可能减少出生时带有该突变的人感染癌症的可能性 。”