IT|基因组分析发现猴痘病毒的变异速度异常快

发表在《自然-医学》上的一项新研究首次对目前在全球蔓延的猴痘病毒进行了强有力的基因组分析 。这项研究将病毒追溯到2017年尼日利亚的猴痘爆发,并表明它迅速产生了异常大量的突变,可能与人与人之间的传播增加有关 。

IT|基因组分析发现猴痘病毒的变异速度异常快
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5月初,一名最近从尼日利亚旅行归来的英国居民被证实患有猴痘 。到本月底,从西班牙、德国和法国到澳大利亚、墨西哥和美国,世界各地又发现了几十个病例 。
这种传播的广泛性是史无前例的 。尽管猴痘在中非和西非部分地区流行,但以前从未在世界范围内大幅传播,科学家们迅速开始研究该病毒的基因组,以了解它来自何处,以及它如何与过去所见的情况不同 。
在葡萄牙的一个科学家团队的领导下,这项新研究对来自感染者的15个不同的病毒样本进行了研究 。研究发现的第一个基因组联系是与2018年和2019年在以色列、新加坡和英国发现的猴痘病例群有关 。
这些病例之前都与从尼日利亚返回的旅行者有关,而基因组关联被进一步追溯到2017/2018年尼日利亚的猴痘爆发 。
这项新研究中最出乎意料的发现或许是揭示了目前的猴痘菌株似乎经历了一个异常快速的变异期 。该项目的首席研究员Jo?o Paulo Gomes说,人们通常只希望看到这种病毒每年积累几个新的突变,但目前流传的迭代似乎包含了大约50个新的突变 。
“考虑到这种2022年的猴痘病毒可能是2017年尼日利亚爆发的猴痘病毒的后代,我们预计(与2018-2019年的进口病毒相比)额外的突变不会超过5到10个,而不是观察到的大约50个突变,”Gomes在疫苗慈善机构Gavi的一篇评论文章中说 。
普遍的假设是,在2019年和2022年之间,该病毒已经在一个流行国家流通了几年而未被发现 。目前的全球爆发很可能来自一个单一来源,然后在2022年初被一个或多个超级传播者事件放大,导致随后在4月和5月检测到的广泛的大规模传播 。
Gomes在接受MedPage Today采访时说,目前检测到的许多突变都与人类免疫系统蛋白有关 。这表明该病毒有可能已经迅速适应了人与人之间的传播 。
Gomes对MedPage Today说:“我们在2022年人与人之间的传播过程中看到的多种突变影响了与人类免疫系统有关的蛋白质,所以它可能意味着对人类的适应过程 。而且,是的,它的发生速度似乎比预期的要快,这与2022年(菌株)与它的祖先相比突变过多的观察结果也是一致的 。”
利物浦热带医学学院的Hugh Adler说,这项新研究强调了我们对猴痘的遗传学知之甚少,这种病毒已经流传了50多年了 。Adler还强调,现在要知道研究中引用的新突变对传播或疾病严重性意味着什么还为时过早 。
Adler解释说:“作者描述了病毒中出乎意料的高数量的突变,但是它们对疾病严重性或传播性的影响还不清楚 。我们没有发现在目前的爆发中诊断的患者的临床疾病严重程度有任何变化 。”
截至2022年6月24日,在大约50个国家已经有超过4100个猴痘病例的报告 。世界卫生组织(WHO)最近召集了一个紧急咨询小组来评估全球形势 。
虽然该小组确实承认“该事件的紧急性质”,但它拒绝建议世卫组织宣布该疫情为国际公共卫生紧急事件(PHEIC) 。当发现一种新的疾病在国际上蔓延,需要全球协调应对来管理时,世卫组织就会宣布为国际关注的公共卫生紧急事件 。目前有两种传染病被宣布为PHEIC:脊髓灰质炎和COVID-19 。
世卫组织在宣布此次猴痘疫情为公共卫生紧急情况方面的犹豫不决受到了一些传染病专家的批评 。全球卫生政策专家Alexandra Phelan在接受《Science Insider》采访时质疑,如果在发生明显的新型传染病传播时,世卫组织的紧急宣布政策如此缓慢地被触发,那么它的目的是什么 。