IT|研究人员发现COVID-19变体或能逃避细胞免疫反应研究人员发现COVID-19变体或能逃

一些现有的SARS-CoV-2毒株，以及未来可能出现的其他变体，有可能在一部分人群中逃避免疫系统的细胞毒性T细胞反应。这是2022年2月10日发表在《PLOS计算生物学》上的一项新的建模研究的结论，作者是西班牙卡洛斯三世健康研究所的Antonio Martín-Galiano及其同事。

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人类的T细胞反应是由HLA分子遗传编码的--这意味着不同的人有不同的HLA，根据病原体的不同部分，或“表位”，程序化地识别入侵的病原体。由于人类有数千种不同的HLA分子，而任何特定的病毒都有数千种可能的表位，因此实验评估每个人类HLA等位基因对每个病毒变体的免疫反应是不可行的。然而，计算方法可以促进这项任务。
在新研究中，研究人员首先确定了来自SARS-CoV-2原始参考毒株的全套表位。研究小组发现SARS-CoV-2的1222个表位与主要的HLA亚型相关，覆盖了大约90%的人类人口；根据这1222个表位，每10个人中至少有9个人可以对COVID-19发起T细胞反应。

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然后，研究人员通过计算分析了国家生物技术信息中心（NCBI）数据集中描述的来自世界各地的11.8万个不同的SARS-CoV-2分离物中是否有任何一个在这些表位上发生了突变。他们显示，47%的表位在至少一个现有的分离物中发生了突变。在某些情况下，现有的分离物在多个表位区域发生了突变，但累积突变对任何特定HLA等位基因类型的表位的影响从未超过15% 。当研究小组分析易感等位基因及其各自的逃逸分离物的地理来源时，研究小组发现它们在一些地理区域--包括撒哈拉以南非洲以及东亚和东南亚--共存，这表明这些地区的细胞毒性T细胞反应面临潜在的遗传压力。

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作者说：“这些变化在独立分离体中的积累仍然太低，不足以威胁到全球人类。我们的方案已经确定了可能与特定人群有关的突变，并值得更深入的监测。”
【IT|研究人员发现COVID-19变体或能逃避细胞免疫反应】然而，Martín-Galiano指出，“未被注意的SARS-CoV-2突变”可能在未来“威胁到人类亚群的细胞毒性T细胞反应” 。