IT|加速新药的开发:MIT的人工智能系统可快速预测蛋白质的附着方式( 二 )
“我们仍然落后于其中一条基线 。我们的方法仍然可以改进,它仍然可以是有用的 。它可以用于一个非常大的虚拟筛选,我们想了解成千上万的蛋白质如何相互作用并形成复合体 。”Ganea说:“我们的方法可以用来非常快速地生成一组最初的候选人,然后可以用一些更准确但更慢的传统方法对这些候选人进行微调 。”
除了将这种方法用于传统模型外,该团队还希望将特定的原子相互作用纳入Equidock,以便它能做出更准确的预测 。例如,有时蛋白质中的原子会通过涉及水分子的疏水相互作用而附着 。
Ganea说,他们的技术也可以应用于类似药物的小分子的开发 。这些分子以特定的方式与蛋白质表面结合,因此快速确定这种附着是如何发生的可以缩短药物开发的时间 。
【IT|加速新药的开发:MIT的人工智能系统可快速预测蛋白质的附着方式】在未来,他们计划加强Equidock,使其能够为灵活的蛋白质对接做出预测 。那里最大的障碍是缺乏训练数据,所以Ganea和他的同事们正在努力生成他们可以用来改进模型的合成数据 。
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