罗斯曼以他的慧眼发现了林奈这匹千里马 ， 没有让他埋没在店铺里 。 在他的帮助和鼓励下 ， 林奈考上了大学 。 1727年 ， 林奈进入瑞典的龙德大学 ， 在这所学校 ， 林奈学习了一年左右遇上了第二位对他很有帮助的老师 ， 著名的博物学家、医生司徒比 。 司徒比无私地对待林奈 ， 传授给他采集标本和制作标本的方法 ， 并且把自己珍藏的全部标本提供给林奈做研究 。 这为林奈奠定了学术基础和经验 。
1728年 ， 林奈转学到更好的学校 ， 即瑞典著名的乌帕萨拉大学 。 在这里 ， 他系统地学习了博物学以及标本制作 ， 成为小有名气的博物学家 ， 崭露头角 。
这次他认识了著名的植物学和医学专家、教授摄尔恩 。 这位善于培养人才的学者发现林奈在植物分类学上的造诣很高 ， 就让他当上了大学助教 ， 还让他独自讲授植物学课 ， 使林奈的才华得到充分施展 。
1732年 ， 瑞典科学院资助考察队 。 林奈和一个探险队来到瑞典北部拉普兰地区进行野外考察 ， 历经艰难 ， 采集了大量植物标本 ， 在方圆约4600英里的荒凉地区发现了100多种新植物 。 此次考察的成果是《拉伯兰植物志》 。
年方25岁的林奈受到瑞典科学院的嘉奖 ， 并且以他的名字命名了一个属为“林奈大属” 。 尽管他很杰出 ， 但由于他提前毕业没有学位 ， 乌帕萨拉大学不能留他任教了 。
林奈很不高兴 ， 闷闷不乐 ， 郁郁寡欢 。 一天 ， 他的邻居莫勒来家作客 ， 看到林奈 ， 觉得他才华出众 ， 很欣赏他 。 老人提出把女儿许配给林奈 ， 不过希望林奈能取得学位 。 1735年 ， 林奈周游各国 ， 在荷兰取得了医学博士学位 ， 完成了自己的心愿 ， 也完成了老人的嘱托 。 同年 ， 林奈出版了《自然系统》的第一版 。
在《自然系统》中 ， 林奈首先提出了以植物的性器官为准则进行分类的标准 。 书的第一版只有薄薄的12页 ， 但很快就产生了影响 。 “知识的第一步 ， 就是要了解事物本身 。 这意味着对客观事物要具有确切的理解；通过有条理的分类和精确的命名 ， 我们可以区分并认识客观物体……分类和命名是科学的基础 。 ”在此 ， 林奈提出了分类的意义 。
植物的有系统的双命名制是博欣与土尔恩福尔首先创立的 ， 林奈更把它加以发展 。 他在拉普兰为了采集北极植物 ， 在拉普兰人中间游历 ， 看到人种显著的差别 。 在他的《自然系统》中 ， 他把人与猿猴、猕猴、蝙蝠同放在“灵长目”中 ， 又按照皮肤的颜色与其他特点 ， 把人分为四类 。
林奈在生物学中最主要工作是建立了人为分类体系和双名制命名法 。 林奈把自然界分为三界 ， 即动物界、植物界和矿物界 。 对于植物界 ， 林奈依据雄蕊和雌蕊的类型、数量及大小等特征 ， 还有蕊的排列顺序 ， 种种条件把植物分为24纲、116目、1000多个属和100000多个种 。 林奈首创了纲、目、属、种的概念 。
林奈把人为分类法运用到动物界 。 1746年他出版《瑞典动物志》 。 在此书中 ， 林奈将动物分为6大纲：鸟纲、两栖纲、哺乳纲、鱼纲、昆虫纲、蠕虫纲 。 他发现 ， 人与类人猿在身体构造上具有相似性 ， 所以把人与猿归入同一个属中 。
林奈成为生物学发展的里程碑 ， 并成为近代以来首先确定人类在动物界的第一人 。
1745年 ， 林奈发表了《欧兰及高特兰旅行记》 。 林奈提出了双名制命名法 ， 并在1753年的《植物种志》中全面推广使用了这种方法 。 双名制就是所有的物种均用两个拉丁字去命名 ， 属名在前 ， 种名在后 ， 学名由属名和种名组成 。 这种命名方式结束了以前的混乱命名现象 。 林奈认为 ， 属名好比整个家族的姓氏 ， 而种名就是每个家庭成员的名字 。 林奈的双名制命名法于1867年被国际植物学会确认 ， 成为全世界统一的命名方法 。
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