南朝刘宋初年，武帝刘裕平河南，又设兖州于滑台（今河南滑县），时称西兖州 。
宋朝大中祥符元年（1008年），兖州升为大都督府，政和八年（1118年）改为袭庆府，治瑕县，隶属山东东路，瑕县（今兖州市）隶属之 。 金朝初置泰宁军，治嵫阳 。
元朝设兖州，治嵫阳；至元十六年（1279年）隶济宁路，辖嵫阳、曲阜、泗水、宁阳四县 。 明代，“嵫阳”改称“滋阳” 。 清朝因之 。
【学习知识|衮怎么读，荣于华衮怎么读】民国初废府存县 。 1958年并入曲阜，新曲阜县城设于兖州城；1961年重设，改称兖州县，隶属济宁；1992年3月1日升为兖州市；2013年10月18日，撤市设兖州区
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