目前用以治疗尖锐湿疣的外用药有很多，原理不外乎两个，一个是具有强烈腐蚀性的药物，涂到疣体上后使组织坏死脱落，如的三氯乙酸溶液，这类药物如果涂到正常皮肤黏膜上，同样可造成化学烧灼，有时可以是很严重的，因此一定要由医护人员掌握使用，患者本人不宜使用;一个是具有抑制细胞生长作用的药物，涂到疣体后抑制了上皮的增生，渐渐疣体脱落消失，常用的有鬼臼毒素、足叶草脂、5-氟尿嘧啶等 。 目前市面上还有一些从中药中提取成分配制成的药膏或药液，作用方式不外上述两种 。 不管用何种药物，都应该在医务人员的指导下使用 。
尖锐湿疣在彻底治愈之后，不会影响到以后的生育，以及怀孕，但由于尖锐湿疣这种病毒非常难以去除，因此，目前来说，如果能够在症状消失之后的一年之内不再次复发，视为已经彻底治愈，否则不建议进行生育 。
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