分集(大结局)德叔终于落网了。庄睿回到北京，决定经营
苗菲菲伪装成文物贩子，他们终于抓住了龙坤，从他嘴里问出了庄睿的下落。得知庄睿在圣艾医院，即将动手术，苗菲菲非常着急，火速赶到医院。
德叔看到自己多年的愿望终于实现了，非常高兴，不断催促医生尽快开始手术。看不上德叔对金瞳的痴迷。他认为即使没有金瞳，他仍然是庄睿。德叔认为金瞳可以改变人的命运。
苗菲菲用乌克兰警察包围了圣爱医院。德叔听了下属的回报，立即命令医生立即开始手术。苗飞飞、赶到病房，德叔用枪指着晕倒的，用的生命威胁他们。苗菲菲让德叔尽快收手，但德叔在最后一刻不愿意放弃。后面的乌克兰警察见说不拢，果断开枪，子弹从德叔脸上飞过。德叔惊呆了，闪到一边。苗菲菲趁机冲上去拦住德叔，在病床上救了。
庄睿在昏昏沉沉的情况下被从圣艾医院带走。看到周围都是关心自己的朋友，他又睡着了。
庄睿和苗菲菲终于结束了基辅之行，回到了北京。去监狱看望正在服刑的秦。秦在狱中的生活很平静。没有勾心斗角，业余时间用来引导感兴趣的犯人学习绘画，生活平淡却充实。看到来看自己，秦有点惊讶和庆幸。告诉她一切都结束了，并给秦带来了一份小礼物。秦得了锦衣卫之礼，原来是她走失的给了她稻草郭。看着这个非同寻常的郭果，秦百感交集。
为了庆祝的九死一生，皇甫云在四合院举行了一场盛大的联欢会，邀请了孟教授、马哥、顾、苗菲菲、刘佳等人。大家在院子里吃着火锅，品尝着巴特尔从草原上送来的两只肥羊肉。皇甫云提议让说几句话，再三婉拒，孟教授才开始先敬酒。每个人都把庄睿视为最可靠、最值得信赖的朋友和伙伴，并高度评价庄睿的愚蠢、执着和赤子之心。年轻的庄睿皇甫云总结了庄睿的特点，开始认为庄睿很蠢。后来，他意识到自己没有心眼，全心全意真诚地对待别人，这让庄睿收获了这么多也愿意全心全意对待他的知己和朋友。每个人说的话都让庄睿非常感动，他也对那些一直支持和陪伴他走过这些不平凡旅程的朋友们表示感谢。
饱餐一顿后，皇甫云把大家一个个送出了四合院。庄睿告诉身边的几个朋友，他白天去了医院，和医生商量了一下，准备动手术彻底清除大脑碎片。皇甫云担心在庄睿这样做有风险，但庄睿想明白全峰在坟墓上说了什么，准备放弃金瞳做一个普通人，他不后悔做出这个决定。皇甫云他们只说，只要是庄睿自己的决定，所有人都会支持他。庄睿骑着自行车在他过去工作和生活的地方转悠，一路上不断回忆他和朋友们的经历。快乐、悲伤、惊讶、激动和欣喜，金瞳带给庄睿的不仅仅是眼神的力量，还让他认识了一些可以相约一生的朋友。
庄睿回到家，留下苗菲菲坐在院子里等他回来。看着菲菲，我想起了从此和菲菲在一起的所有经历。庄睿和苗菲菲相视一笑，很多事情不需要说有默契。
【黄金瞳大结局 黄金瞳大结局剧情第56集介绍（共56集）】最后，手术来了，他们陪着庄睿进了手术室，为他加油。庄睿还向每个人承诺，他将移除压迫他神经的碎片，成为一个健康的庄睿。
刚进手术室，中川就打电话给皇甫云，告诉他一个惊人的消息，德叔叔已经从拘留室消失了。原来是小岛安排来救德叔的。一直在寻找金瞳的德大叔，终于决定自己动手术，获得金瞳的能力。小岛帮他安排好了一切，但是操作并没有想象中的轻松顺利。
庄睿躺在病床上。他并不后悔自己即将失去金瞳的能力，但是碎片能如他所愿顺利移除吗？还是会有什么新的变化？大家都在紧张地等待最后的结果。
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