奥密克戎变异那么多，核酸检测还能“揪出”它吗？

本文转自：上观

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近日，中国疾病预防控制中心专家谈及奥密克戎变异株的检测，指出对奥密克戎变异株的基因组分析显示，其突变位点不位于我国第八版《新型冠状病毒肺炎防控方案》公布的核酸检测试剂引物和探针靶标区域，不影响我国主流核酸检测试剂的敏感性和特异性。
也就是说，奥密克戎株变异虽然不少，但我国现有的核酸检测试剂仍然能够准确检测到它。采访人员查阅了第八版《新型冠状病毒肺炎防控方案》附件中公布的核酸检测方法，显示目前用于新冠病毒核酸检测的主要靶标为病毒基因组中的开放读码框1ab（ORF1ab）和核壳蛋白（N蛋白）。这些概念是什么意思？为何不影响奥密克戎检测结果？对此，解放日报·上观新闻采访人员采访了上海交通大学医学院上海市免疫学研究所王颖教授，请她解释其中原理。
王颖介绍，新冠病毒有四种主要的结构蛋白，包括刺突蛋白（S蛋白）、核壳蛋白（N蛋白）、膜蛋白（M蛋白）、包膜蛋白（E蛋白）。下图是几个结构蛋白在病毒颗粒上的分布情况：

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引自Kirtipal N et al. Infection, Genetics and Evolution 2020
此外新冠病毒基因组编码的ORF1a和ORF1b蛋白属于非结构蛋白，主要负责编码与病毒复制和转录相关的酶，帮助新冠病毒在宿主细胞中“肆虐” 。对于不同新冠病毒株的序列分析结果显示ORF1ab的核酸序列较为稳定，变异概率低。
由于奥密克戎变异株的突变位点主要集中在刺突蛋白上，因此并不影响对编码N蛋白与ORF1ab蛋白的基因检测。打个形象的比方，如果新冠病毒随身携带多种身份证件，核酸检测就好像是通过查看身份证件来“揪出”新冠病毒这个“通缉犯” 。现有核酸检测根据新冠病毒的身份证和护照信息判断其“身份” ，而奥密克戎变异后主要改变的是驾照信息，自然不影响对其“身份”判断的准确性。
此外，同时检测两种靶标，本身也给核酸检测的准确性上了“双保险” 。根据第八版《新型冠状病毒肺炎防控方案》，通过荧光RT-PCR检测新冠病毒两个靶标——开放读码框1ab和核壳蛋白，在两种情况下实验室可将标本主人确认为阳性病例：一是同一份标本中2个靶标结果均为阳性；二是两种标本（比如同一个人的鼻咽拭子和口咽拭子）同时出现单靶标阳性，或同种类型标本2次出现单个靶标阳性。
【奥密克戎变异那么多，核酸检测还能“揪出”它吗？｜新科普】既然核酸检测可以准确“揪出”奥密克戎，为什么针对重点人群还要进行多次核酸检测呢？王颖介绍，这主要和病毒载量以及采样部位有关。“有可能第一次检测时，感染者病毒载量不高，或者采样部位还没有被新冠病毒感染。随着病毒在体内不断复制，病毒载量增高、感染人体更多部位，核酸检测结果就有可能由阴转阳。”

奥密克戎变异那么多，核酸检测还能“揪出”它吗？｜新科普

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